1984年，冯远征在报考北京电影学院表演系的考场上，被导演张暖昕选中，出演电影《青春祭》中的男主角任佳，开始了他的艺术生涯。1997年，与徐帆主演冯小刚执导的电视剧《月亮背面》；1998年，主演为纪念戊戌变法100周年而创作的电视剧《戊戌风云》，饰演光绪。1999年，参演李保田自导自演的电视剧《烟壶》，饰演“徐狗子”

2001年，参演《不要和陌生人说话》饰演暴力的安嘉和。

2004年，凭借《美丽上海》获得第24届中国电影金鸡奖最佳男配角奖；12月，在冯小刚的贺岁电影《天下无贼》中饰演娘娘腔劫匪，金鸡奖最佳男配角奖。

2005年，自导自演电视剧《滴血玫瑰》。

2006年，与殷桃、邓超主演反映“无性婚姻”题材的电视剧《爱了散了》播出，反应家庭冷暴力的“无性婚姻”的话题成为大家关注的焦点。2007年，在电视剧《阳光普照大地》饰演20世纪70年代的工人。

2008年，在冯小刚电影《非诚勿扰》里饰演一个娘娘腔，提名第三十届大众电影百花奖最佳男配角。2009年，主演电视剧《侦探小说》，挑战患有人格分裂症的警长刘志文，剧中冯远征不仅首次挑战动作戏，还分饰父子两角；参演电视剧《新人到中年》，扮演了一位“妻管严”。

2012年2月，与李玉刚、余少群主演电视《百花深处》，冯远征在继《不要和陌生人说话》之后，再次在电视剧中演绎变态角色，迷恋上了李玉刚饰演的男旦萧俊生。

2011年1月，与陈宝国合作电视剧《钢铁年代》，出演炼钢工程师，与陈宝国饰演一对“宿命冤家”。2012年，与闫妮合作电视剧《煮妇也疯狂》。

2014年1月，主演爱情喜剧电视剧《男媒婆》，饰演喜感十足的土豪老板“潘高峰”。同年，参演电视剧《老农民》。同年参演电视剧《无名者》。

2015年4月，冯远征受聘为南开大学的“校园文化大使”，并做客南开文化周末艺术沙龙，与现场500余名学生分享他的如戏人生。4月16日至25日与余少群主演的《风雪夜归人》登陆国家大剧院。凭借《老农民》获得第21届上海电视节最佳男配角奖。

2016年11月，参演抗战剧《不可能完成的任务》。

2018年1月21日，在第十届全国德艺双馨电视艺术工作者表彰大会中获得了“全国德艺双馨电视艺术工作者”荣誉称号。

2019年8月20日，北京人艺首部大剧场原创新戏《杜甫》首轮将演出至8月25日，该戏由冯远征首次独立执导兼主演。11月22日，其领衔主演的犯罪悬疑电影《你是凶手》上映。